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課程名稱 : 生物資訊分析課程
指導老師 : 鄧致剛 老師

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 Bacillibactin.png       圖:bacillibactin

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首先利用 Uniport 搜尋 siderophore 


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feuA 則是屬於 bacterial solute-binding protein 8 family

這個 family 大多是和 Fe binding 有關的 gene

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將 feuA 的序列去做 blast 

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到 NCBI 尋找 feuA 的 sequence 後存成 FASTA 送到GCG 中,轉成GCG格式

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這則是 feuA 對應出來的 protein - Iron uptake-binding lipoprotein

在 NCBI 以 FASTA 的格式存下來後一樣用 fromfast 的指令去切割

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利用 InterPro 資料庫尋找 Iron uptake-binding lipoprotein 的 functional domain

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利用 KEGG 搜尋 feuA 所參與的 ABC transporter pathway 

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將同樣有 feuA gene 的不同細菌,各自的 feuA gene 下載下來,細菌分別為 Bacillus amyloliquefaciens. Bacillus pumilus. Bacillus thuringiensis. Lysinibacillus sphaericus 和 Paenibacillus mucilaginosus

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